Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKV5

Scamp4, Secretory carrier-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp4Q9JKV5 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Scamp4Q9JKV5 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 AC134329.2-201ENSMUST00000217897 428 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Olfr317-201ENSMUST00000075607 1128 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Scamp4Q9JKV5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms