Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKS5

Habp4, Intracellular hyaluronan-binding protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Habp4Q9JKS5 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Gm10576-201ENSMUST00000191927 825 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Kcnk10-203ENSMUST00000221305 1357 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Cdca4-202ENSMUST00000220899 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Gm11860-201ENSMUST00000122346 1010 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Tbcc-201ENSMUST00000040434 1164 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Klhdc1-201ENSMUST00000063445 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Rilp-201ENSMUST00000042972 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Gm9954-202ENSMUST00000198686 4725 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Gm43332-201ENSMUST00000202511 1044 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Arl3-201ENSMUST00000026009 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
Habp4Q9JKS5 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Tnnt1-203ENSMUST00000108587 1059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Gm28050-201ENSMUST00000124394 449 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Gm43575-201ENSMUST00000196420 516 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Lmtk2-201ENSMUST00000041804 8114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Habp4Q9JKS5 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms