Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKP7

Pole3, DNA polymerase epsilon subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pole3Q9JKP7 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Zfp334-201ENSMUST00000103084 8205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Kif7-201ENSMUST00000059836 4521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Pole3Q9JKP7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Chmp4c-201ENSMUST00000029049 6188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Scube3-201ENSMUST00000043503 6699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gabrb3-201ENSMUST00000039697 5579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Pole3Q9JKP7 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms