Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gm44291-201ENSMUST00000203102 2865 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Slc4a5-203ENSMUST00000113900 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Zdhhc1-201ENSMUST00000044286 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Grik5-201ENSMUST00000003468 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Nabp1-201ENSMUST00000027279 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Il15ra-201ENSMUST00000078834 1600 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Slc52a3-203ENSMUST00000109859 2204 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Zfp668-204ENSMUST00000106263 3132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gjd2-201ENSMUST00000090275 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Rhot1-203ENSMUST00000077451 3297 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Phax-201ENSMUST00000008445 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Syt17-204ENSMUST00000203796 2957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 2700080J24Rik-201ENSMUST00000205314 1662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Esco1-202ENSMUST00000097670 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Trem1Q9JKE2 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Dact1-201ENSMUST00000061273 3650 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Stk40-201ENSMUST00000094761 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Cpz-201ENSMUST00000038676 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Fbxo46-202ENSMUST00000165913 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Matk-203ENSMUST00000119547 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Mcrs1-201ENSMUST00000041190 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Cdk19os-202ENSMUST00000143103 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Trem1Q9JKE2 Selplg-201ENSMUST00000100874 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.3 ms