Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE1

Trem3, TREM-3, mousemouse

Predictions only

Length 183 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem3Q9JKE1 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC13.74□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
Trem3Q9JKE1 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Trem3Q9JKE1 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms