Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKD3

Scamp5, Secretory carrier-associated membrane protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 235 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp5Q9JKD3 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Cklf-208ENSMUST00000212433 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Scamp5Q9JKD3 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms