Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3m1Q9JKC8 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3m1Q9JKC8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3m1Q9JKC8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3m1Q9JKC8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3m1Q9JKC8 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ap3m1Q9JKC8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3m1Q9JKC8 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3m1Q9JKC8 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3m1Q9JKC8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3m1Q9JKC8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ap3m1Q9JKC8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Slmap-203ENSMUST00000102956 5476 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ap3m1Q9JKC8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms