Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC7

Ap4m1, AP-4 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 449 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap4m1Q9JKC7 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Ccdc88b-201ENSMUST00000113440 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Mlf2-201ENSMUST00000032214 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Ttc13-203ENSMUST00000118134 3277 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Ubn1-201ENSMUST00000052449 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Ap4m1Q9JKC7 Nefh-201ENSMUST00000093369 3994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Mastl-201ENSMUST00000028119 5590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.13□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Foxo3-201ENSMUST00000056974 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Cdon-202ENSMUST00000119129 7503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Bicd2-203ENSMUST00000110085 4588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Ankrd9-205ENSMUST00000142012 1226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Wnk2-207ENSMUST00000159559 6584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Chchd4-201ENSMUST00000040835 3472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Ap4m1Q9JKC7 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.12□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.9 ms