Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK83

Pard6b, Partitioning defective 6 homolog beta, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard6bQ9JK83 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Klf5-201ENSMUST00000005279 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Naa35-201ENSMUST00000022038 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Snx30-201ENSMUST00000030080 7314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Gm42569-201ENSMUST00000200539 472 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Tnfaip2-202ENSMUST00000109792 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Rasgef1b-205ENSMUST00000161148 2430 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 3110062M04Rik-202ENSMUST00000115006 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pard6bQ9JK83 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.2 ms