Protein–RNA interactions for Protein: Q9JK48

Sh3glb1, Endophilin-B1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh3glb1Q9JK48 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
Sh3glb1Q9JK48 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Fdft1-204ENSMUST00000224625 3698 ntAPPRIS P1 BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Adamts17-202ENSMUST00000107478 6416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Cdc42ep1-201ENSMUST00000059619 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Wnt8b-201ENSMUST00000041163 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Ppm1e-201ENSMUST00000055438 6344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Asic4-201ENSMUST00000037708 2464 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Sh3glb1Q9JK48 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms