Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJS6

Bco1, Beta,beta-carotene 15,15'-dioxygenase, mousemouse

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Length 566 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bco1Q9JJS6 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Bco1Q9JJS6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Bco1Q9JJS6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Bco1Q9JJS6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Bco1Q9JJS6 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
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Bco1Q9JJS6 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Bco1Q9JJS6 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Bco1Q9JJS6 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Bco1Q9JJS6 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Bco1Q9JJS6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Bco1Q9JJS6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Bco1Q9JJS6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Bco1Q9JJS6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Bco1Q9JJS6 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Bco1Q9JJS6 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Bco1Q9JJS6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Bco1Q9JJS6 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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