Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJF3

Riox1, Ribosomal oxygenase 1, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riox1Q9JJF3 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.33■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
Riox1Q9JJF3 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Riox1Q9JJF3 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.4 ms