Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ89

Ccdc86, Coiled-coil domain-containing protein 86, mousemouse

Predictions only

Length 426 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc86Q9JJ89 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Zbtb9-201ENSMUST00000120016 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Polr1c-201ENSMUST00000087026 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Ccdc86Q9JJ89 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 H2afz-207ENSMUST00000174561 810 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Ccdc86Q9JJ89 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms