Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ80

Rpf2, Ribosome production factor 2 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 306 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpf2Q9JJ80 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rpf2Q9JJ80 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Adss-201ENSMUST00000016105 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rpf2Q9JJ80 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms