Protein–RNA interactions for Protein: Q9JIM3

Ercc6l2, DNA excision repair protein ERCC-6-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,537 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ercc6l2Q9JIM3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Gm10605-201ENSMUST00000182342 665 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 5830454E08Rik-202ENSMUST00000213974 744 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Chd3os-202ENSMUST00000151617 389 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Alkbh7-201ENSMUST00000002737 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Cav3-201ENSMUST00000075477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Gm12428-201ENSMUST00000119844 727 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Tmem107-202ENSMUST00000094081 1263 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Cldn11-201ENSMUST00000046174 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Dio1-202ENSMUST00000106748 396 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Gpx4-207ENSMUST00000183037 735 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Syce1l-201ENSMUST00000034219 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Syce1l-202ENSMUST00000095173 791 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ercc6l2Q9JIM3 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Atf7ip2-203ENSMUST00000117220 1230 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Cnpy1-201ENSMUST00000117098 2661 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Isoc2a-201ENSMUST00000125249 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Igf2-203ENSMUST00000105935 650 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Mesp1-201ENSMUST00000032760 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Blcap-201ENSMUST00000088494 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 4930544D05Rik-203ENSMUST00000144960 624 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 AC155729.1-201ENSMUST00000227758 544 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Eif4g3-201ENSMUST00000058133 2663 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Gm11724-201ENSMUST00000125577 472 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Vps53-204ENSMUST00000129256 650 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Mrpl20-201ENSMUST00000030942 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Sbk2-201ENSMUST00000032598 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Arx-201ENSMUST00000046565 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ercc6l2Q9JIM3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.7 ms