Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHK4

Rabggta, Geranylgeranyl transferase type-2 subunit alpha, mousemouse

Predictions only

Length 567 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RabggtaQ9JHK4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Pym1-202ENSMUST00000163377 1158 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Crocc-202ENSMUST00000097816 6273 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
RabggtaQ9JHK4 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Lysmd4-209ENSMUST00000208998 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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RabggtaQ9JHK4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
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RabggtaQ9JHK4 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Aqp5-202ENSMUST00000169082 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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RabggtaQ9JHK4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
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RabggtaQ9JHK4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Rnf186-201ENSMUST00000116094 1249 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Hotairm1-202ENSMUST00000132559 713 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
RabggtaQ9JHK4 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
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RabggtaQ9JHK4 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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