Protein–RNA interactions for Protein: Q9ET38

Cldn19, Claudin-19, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn19Q9ET38 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
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Cldn19Q9ET38 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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Cldn19Q9ET38 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cldn19Q9ET38 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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