Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESN6

Trim2, Tripartite motif-containing protein 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 744 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim2Q9ESN6 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Trim2Q9ESN6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Bard1-201ENSMUST00000027393 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Magi1-202ENSMUST00000089317 7209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 St8sia6-201ENSMUST00000003509 7618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Trim2Q9ESN6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.8 ms