Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESG2

Ropn1, Ropporin-1, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1Q9ESG2 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Kri1-201ENSMUST00000038671 2598 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Prpf3-207ENSMUST00000161476 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Ropn1Q9ESG2 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Apeh-206ENSMUST00000193254 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 App-203ENSMUST00000226801 3299 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Ttll11-202ENSMUST00000112976 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Ropn1Q9ESG2 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 77.2 ms