Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESD6

Cmtm7, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmtm7Q9ESD6 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cmtm7Q9ESD6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cmtm7Q9ESD6 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms