Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERN0

Scamp2, Secretory carrier-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scamp2Q9ERN0 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Scamp2Q9ERN0 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Zrsr2-202ENSMUST00000112289 2735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Scamp2Q9ERN0 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms