Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERH8

Slc28a3, Solute carrier family 28 member 3, mousemouse

Predictions only

Length 703 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc28a3Q9ERH8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Slc28a3Q9ERH8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Gm26596-201ENSMUST00000180464 2655 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Slc28a3Q9ERH8 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms