Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB5

Slco1c1, Solute carrier organic anion transporter family member 1C1, mousemouse

Predictions only

Length 715 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slco1c1Q9ERB5 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Chst10-206ENSMUST00000194361 2996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Acp4-203ENSMUST00000118216 1454 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Slco1c1Q9ERB5 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms