Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Mfsd4b3-201ENSMUST00000095749 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 3110040N11Rik-201ENSMUST00000026092 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Clstn2Q9ER65 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Adprh-201ENSMUST00000002923 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Osbpl1a-207ENSMUST00000121808 3030 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Stxbp5l-202ENSMUST00000114775 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Clstn2Q9ER65 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms