Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQZ6

Rapgef4, Rap guanine nucleotide exchange factor 4, mousemouse

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Length 1,011 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rapgef4Q9EQZ6 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15372-201ENSMUST00000120729 834 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Lce3c-201ENSMUST00000055375 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Oraov1-203ENSMUST00000105895 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Rapgef4Q9EQZ6 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Ogfod2-201ENSMUST00000024470 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 4930519L02Rik-201ENSMUST00000197683 619 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Rapgef4Q9EQZ6 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms