Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Slc35a1-201ENSMUST00000029970 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Nr2c2ap-202ENSMUST00000211898 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 AC160393.1-201ENSMUST00000218378 1279 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Nectin2-201ENSMUST00000075447 2735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Erf-201ENSMUST00000045847 3505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ropn1lQ9EQ00 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Taf10-203ENSMUST00000141116 4281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Tpd52l1-201ENSMUST00000000305 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Nodal-201ENSMUST00000049339 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Sdf4-204ENSMUST00000105579 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Prr22-201ENSMUST00000168666 1350 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Gm4553-201ENSMUST00000168049 714 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Sgpp1-201ENSMUST00000021450 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Irf2bpl-201ENSMUST00000038422 4098 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ropn1lQ9EQ00 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms