Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPL2

Clstn1, Calsyntenin-1, mousemouse

Predictions only

Length 979 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn1Q9EPL2 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Aldoa-ps3-201ENSMUST00000217558 306 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Myoz1-201ENSMUST00000090469 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Clstn1Q9EPL2 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 4732471J01Rik-202ENSMUST00000205787 991 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Smim15-205ENSMUST00000225972 2097 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Clstn1Q9EPL2 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 397.4 ms