Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCU6

Mrpl4, 39S ribosomal protein L4, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl4Q9DCU6 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Mrpl4Q9DCU6 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms