Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCP2

Slc38a3, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc38a3Q9DCP2 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
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Slc38a3Q9DCP2 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Slc38a3Q9DCP2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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