Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCG9

Trmt112, Multifunctional methyltransferase subunit TRM112-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt112Q9DCG9 Rcn1-201ENSMUST00000006128 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trmt112Q9DCG9 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC19.52■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trmt112Q9DCG9 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.9 ms