Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD6

Gabarap, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GabarapQ9DCD6 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Bend6-204ENSMUST00000129464 1750 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Cap1-203ENSMUST00000106257 2768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Taf5l-201ENSMUST00000093039 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Iqsec1-202ENSMUST00000101153 8036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Gps1-202ENSMUST00000116305 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Wnt16-201ENSMUST00000031681 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Sbk2-202ENSMUST00000182214 2236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GabarapQ9DCD6 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms