Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCD2

Xab2, Pre-mRNA-splicing factor SYF1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xab2Q9DCD2 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Xab2Q9DCD2 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Xab2Q9DCD2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms