Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU5

Rnf6, E3 ubiquitin-protein ligase RNF6, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf6Q9DBU5 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Rnf6Q9DBU5 Rogdi-207ENSMUST00000202281 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms