Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBQ9

Swt1, Transcriptional protein SWT1, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Swt1Q9DBQ9 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Swt1Q9DBQ9 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
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Swt1Q9DBQ9 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Swt1Q9DBQ9 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
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Swt1Q9DBQ9 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Swt1Q9DBQ9 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
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Swt1Q9DBQ9 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Swt1Q9DBQ9 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
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Swt1Q9DBQ9 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Swt1Q9DBQ9 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms