Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBG7

Srpra, Signal recognition particle receptor subunit alpha, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 636 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrpraQ9DBG7 Gpd1-203ENSMUST00000162194 1515 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
SrpraQ9DBG7 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.8 ms