Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB70

Fundc1, FUN14 domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc1Q9DB70 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Ankrd13b-201ENSMUST00000037593 3105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC17.33■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Fundc1Q9DB70 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Fundc1Q9DB70 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.9 ms