Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAL0

Smim23, Small integral membrane protein 23, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim23Q9DAL0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Marc2-201ENSMUST00000068725 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Fars2-201ENSMUST00000021857 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Gm19094-201ENSMUST00000209791 1246 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Hes3-202ENSMUST00000218045 962 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Kif1c-201ENSMUST00000072187 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Cry1-201ENSMUST00000020227 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Gm5934-201ENSMUST00000120734 2588 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Snx17-201ENSMUST00000031029 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Cep57-201ENSMUST00000034398 2523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Shank3-202ENSMUST00000066545 4702 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Repin1-207ENSMUST00000163452 2959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Smim23Q9DAL0 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.5 ms