Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAD6

Pfn3, Profilin-3, mousemouse

Predictions only

Length 137 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfn3Q9DAD6 Smpdl3b-201ENSMUST00000030709 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Pfn3Q9DAD6 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms