Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.52□□□□□ -0.24
Tmem239Q9DA47 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Pde4dip-201ENSMUST00000045243 6185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Cep170b-211ENSMUST00000222711 6566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Sike1-201ENSMUST00000029447 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Tnfrsf11a-201ENSMUST00000027559 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Aptx-202ENSMUST00000068125 5383 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Map4-201ENSMUST00000035055 6091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Gm37805-201ENSMUST00000192612 1094 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Chst8-203ENSMUST00000154629 2079 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Gm14026-201ENSMUST00000120625 1789 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Tmem239Q9DA47 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms