Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA42

Uncharacterized protein C20orf85 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DA42 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Q9DA42 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gm13074-201ENSMUST00000124848 2735 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gm26663-201ENSMUST00000181105 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Q9DA42 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Fut7-203ENSMUST00000114278 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Fut7-201ENSMUST00000041654 1970 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Fhl1-201ENSMUST00000023854 2356 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Spdya-204ENSMUST00000167641 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Taok3-202ENSMUST00000111975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Raxos1-201ENSMUST00000181100 2547 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Psmd12-203ENSMUST00000106752 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Q9DA42 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Klhdc4-201ENSMUST00000045884 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Snx9-201ENSMUST00000002436 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gpc5-202ENSMUST00000175665 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Tmem50b-201ENSMUST00000023686 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Mrpl40-201ENSMUST00000023391 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Dera-201ENSMUST00000087675 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gm16279-201ENSMUST00000149452 2945 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Sucla2-203ENSMUST00000160507 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Q9DA42 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Sirt6-201ENSMUST00000042923 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Q9DA42 Ankrd13a-201ENSMUST00000102578 3717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms