Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

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Length 209 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC16.77■□□□□ 0.28
Cldn34b2Q9D9N2 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
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Cldn34b2Q9D9N2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Cldn34b2Q9D9N2 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms