Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9J3

Actrt1, Actin-related protein T1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Actrt1Q9D9J3 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Rpl5-201ENSMUST00000082223 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Zbtb4-201ENSMUST00000108638 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Snrk-201ENSMUST00000118886 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Actrt1Q9D9J3 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 P2ry2-206ENSMUST00000208340 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Impdh1-205ENSMUST00000160878 2314 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Papola-202ENSMUST00000109901 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 P3h1-201ENSMUST00000030393 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Sdf2l1-201ENSMUST00000023453 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Ccdc71l-201ENSMUST00000172332 4240 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Stx7-201ENSMUST00000020174 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gm26560-201ENSMUST00000181240 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Cadps2-205ENSMUST00000115358 4848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Coq8b-201ENSMUST00000003860 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Vps51-201ENSMUST00000025711 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gm26891-201ENSMUST00000181644 2599 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Akp-ps1-202ENSMUST00000212812 1959 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Rsrc1-205ENSMUST00000161726 3213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Bicdl1-204ENSMUST00000121746 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Actrt1Q9D9J3 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms