Protein–RNA interactions for Protein: Q9D906

Atg7, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme ATG7, mousemouse

Predictions only

Length 698 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg7Q9D906 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Urah-202ENSMUST00000106050 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Xxylt1-201ENSMUST00000055389 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Atg7Q9D906 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms