Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Chrac1-202ENSMUST00000134353 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Dock4-201ENSMUST00000037488 8552 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Sec24a-204ENSMUST00000109097 6581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Haspin-201ENSMUST00000052140 2810 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Nipa2-201ENSMUST00000032635 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Tmem33-204ENSMUST00000161369 6164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Adam9-204ENSMUST00000208247 4044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Atoh1-201ENSMUST00000101351 2121 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Lrch1-205ENSMUST00000228252 3125 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Clec16a-204ENSMUST00000115824 6244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Clec16a-202ENSMUST00000066345 6244 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Kif21a-203ENSMUST00000100304 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Kif21a-202ENSMUST00000088614 6439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Snx5Q9D8U8 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms