Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U4

C1qtnf2, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1qtnf2Q9D8U4 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Gm43702-201ENSMUST00000198772 2546 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Hsf5-201ENSMUST00000093956 4158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
C1qtnf2Q9D8U4 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
C1qtnf2Q9D8U4 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms