Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U0

Ifrd2, Interferon-related developmental regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifrd2Q9D8U0 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ifrd2Q9D8U0 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifrd2Q9D8U0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifrd2Q9D8U0 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifrd2Q9D8U0 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ifrd2Q9D8U0 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms