Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Wdr13-202ENSMUST00000115623 1749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Cdc23-201ENSMUST00000025228 2084 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Tjap1-214ENSMUST00000225413 2189 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Rabl6-201ENSMUST00000058137 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rexo2Q9D8S4 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Wdr45-201ENSMUST00000043045 1609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Kctd15-203ENSMUST00000108070 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Dtx2-202ENSMUST00000111142 2650 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rexo2Q9D8S4 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms