Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Jam3Q9D8B7 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gm37812-201ENSMUST00000195216 2475 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Pde8b-208ENSMUST00000162292 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Trim31-201ENSMUST00000078438 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Jam3Q9D8B7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.8 ms