Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B4

Ndufa11, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa11Q9D8B4 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
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Ndufa11Q9D8B4 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ndufa11Q9D8B4 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ndufa11Q9D8B4 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ndufa11Q9D8B4 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Ndufa11Q9D8B4 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ndufa11Q9D8B4 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ndufa11Q9D8B4 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ndufa11Q9D8B4 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ndufa11Q9D8B4 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Ndufa11Q9D8B4 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Ndufa11Q9D8B4 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa11Q9D8B4 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ndufa11Q9D8B4 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa11Q9D8B4 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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Ndufa11Q9D8B4 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Ndufa11Q9D8B4 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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