Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J7

Capns2, Calpain small subunit 2, mousemouse

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Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns2Q9D7J7 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm26689-201ENSMUST00000180927 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm26553-201ENSMUST00000181531 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Neil2-201ENSMUST00000038229 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 2310001H17Rik-206ENSMUST00000205051 676 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm34030-202ENSMUST00000211434 1126 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Magohb-201ENSMUST00000032307 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Fmr1nb-201ENSMUST00000069731 799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 2210408F21Rik-210ENSMUST00000151076 539 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Mymx-202ENSMUST00000169137 616 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Hsd3b2-203ENSMUST00000177651 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Pqlc1-207ENSMUST00000140594 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gjb1-203ENSMUST00000119190 1585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Cnih1-201ENSMUST00000015903 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm14140-201ENSMUST00000119999 995 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm9727-201ENSMUST00000161387 555 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 1810010D01Rik-204ENSMUST00000208788 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Pdcd6-201ENSMUST00000022060 1131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Pts-201ENSMUST00000034570 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Krt4-201ENSMUST00000023797 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Cables2-201ENSMUST00000108891 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Capns2Q9D7J7 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Snupn-201ENSMUST00000068856 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Lrrc3c-201ENSMUST00000142268 902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Ubl5-204ENSMUST00000160682 489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Nudt3-209ENSMUST00000176876 465 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm45231-201ENSMUST00000208629 1064 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Nudt3-202ENSMUST00000062397 558 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Tmem217-201ENSMUST00000114683 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 AC090659.1-201ENSMUST00000224334 768 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Pfn3-201ENSMUST00000054146 545 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Capns2Q9D7J7 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.8 ms